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Optimisation de l’identification et du dénombrement du microphytoplancton avec le système couplé de numérisation et d’analyse d’images FlowCAM – Zoo/PhytoImage (système innovant). Action 9 – Livrable 3. Evolution du matériel de numérisation : prototype FastCAM et perspectives. Rapport final, février 2016 ArchiMer
Colas, Florent; Tardivel, Morgan; Evrard, Justine; Forest, Bertrand; Crassous, Marie-pierre; Lunven, Michel; Danielou, Marie-madeleine.
This deliverable contains all development work of the FastCAM, new tool for fast imaging of the phytoplankton, which took place in 2015. It consists of: One report of the FastCAM and its comparison with the FlowCAM presentation: The FlowCAM enables the digitalization of a sample of phytoplankton with X10 and X 4 magnifications. The first allows a better morphological description and therefore a higher taxonomic resolution but with a longer scan time (16 X). Thus, for routine analyses, only scanning at 4 X is possible. A considerable gain would be able to do an acquisition to the magnification 10 X with a time of analysis more short, comparable to 4 X. A fast flow imaging system has therefore developed in this sense. He was called FastCAM. The system is...
Tipo: Text Palavras-chave: FlowCAM; FastCAM; Imagerie rapide; Phytoplancton; REPHY.; FlowCAM; FastCAM; Fast imaging; Phytoplankton; REPHY.
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00363/47420/47425.pdf
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Suivi estival des lagunes méditerranéennes françaises - Bilan des résultats 2014 ArchiMer
Derolez, Valerie; Oheix, Jocelyne; Ouisse, Vincent; Munaron, Dominique; Fiandrino, Annie; Messiaen, Gregory; Hubert, Clarisse; Lamoureux, Alice; Malet, Nathalie; Fortune, Martine; Berard, Lucas; Mortreux, Serge; Guillou, Jean-louis.
Le Réseau de Suivi Lagunaire (RSL), qui permettait d’évaluer l’état vis-à-vis de l’eutrophisation des lagunes du Languedoc-Roussillon, a pris fin en 2013. Une campagne DCE d’évaluation de l’état des masses d’eau côtières et de transition de la façade méditerranéenne est programmée en 2015. Ce rapport rend compte des suivis réalisés par Ifremer en 2014 sur 22 masses d’eau lagunaires du bassin Rhône-Méditerranée et Corse (financement AERMC). Un diagnostic de l’état des masses d’eau, intégrant l’état physico-chimique de la colonne d’eau et l’état du phytoplancton est établi pour les 22 masses d’eau (dont 4 oligo-mésohalines), à partir des données acquises sur la période 2009-2014, selon les critères et les grilles DCE. Trois masses d’eau (Thau,...
Tipo: Text Palavras-chave: Directive Cadre sur l’Eau (DCE); Lagunes; Masses d’eau de transition; Phytoplancton; Macrophytes; Sédiments..
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00273/38461/36864.pdf
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Rapport d'activités 2018 du Laboratoire Environnement Ressources Conchylicoles du Morbihan-Pays de Loire ArchiMer
Cochennec-laureau, Nathalie; Bellec, Gwenael; Bizzozero, Lucie; Bonneau, Francoise; Bouget, Jean-francois; Bouvier, Calypso; Collin, Karine; Fortune, Mireille; Gabellec, Raoul; Le Merrer, Yoann; Manach, Soazig; Mellor, Alice; Pierre-duplessix, Olivier; Reboul, Sebastien; Retho, Michael; Roux, Pauline; Schapira, Mathilde; Schmitt, Anne; Souchu, Philippe; Stanisiere, Jean-yves.
Activités d’observation, de surveillance de la qualité des eaux littorales du Morbihan, Pays de Loire et Nord Vendée et résultats des projets de recherche 2018
Tipo: Text Palavras-chave: Réseaux de surveillance et d’observation; Qualité des écosystèmes marins littoraux du Morbihan; Pays de Loire; Microbiologie; Phytoplancton; Eutrophisation; Ressources exploitées; Huîtres; Moules.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00481/59245/61969.pdf
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Bilan des observations hydrologiques du secteur côtier au large de la Loire et de la Vilaine en 2018 ArchiMer
Collin, Karine; Bizzozero, Lucie; Le Merrer, Yoann; Retho, Michael; Pierre-duplessix, Olivier; Souchu, Philippe; Cochennec-laureau, Nathalie.
Ce rapport décrit le contexte hydrologique du littoral côtier du Morbihan, Pays de Loire et Nord Vendée, durant l’année 2018. Il s’appuie sur les suivis environnementaux réalisés dans le cadre des réseaux REPHY et de la DCE, complétés des données acquises en haute fréquence sur la bouée MOLIT et sur le secteur du Bois de la Chaise.
Tipo: Text Palavras-chave: Hydrologie; DCE; Nutriment; Loire Bretagne; Rephy; Phytoplancton.
Ano: 2020 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00634/74571/74443.pdf
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Biomasse et production primaire du phytoplancton et du microphytobenthos de deux biotopes sableux (Golfe de Fos, France) ArchiMer
Plante-cuny, Marie-reine; Bodoy, Alain.
The primary production (phytoplankton and microphytobenthos) of a coastaL shallow water ecosystem (0.5 m) was investigated in two sandy areas, differing by their wave exposure. The physical and chemical parameters, the functional chlorophyll and pheopigments as well as the primary production were measured monthly, throughout a two-year study. The bivalve Ruditapes decussatus was the dominant species in the sheltered station (RD), whereas Donax trlmcu/us inhabited the other station (DT) which was exposed to the open-sea waves. Microphytic biomasses were determined after extracting chlorophyll a and pheopigments in 90% acetone. by spectrophotometric measurements before and after acidification. Gross hourly primary production was estimated by measuring the...
Tipo: Text Palavras-chave: Biomasse; Production primaire; Phytoplancton; Microphytobenthos; Mediterranee; Biomass; Primary production; Phytoplancton; Microphytobenthos; Mediterranean.
Ano: 1987 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/1987/publication-2870.pdf
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Modélisation 0D des efflorescences d'Alexandrium en rade de Brest en compétition inter-spécifique ArchiMer
Le Gland, Guillaume.
Since 2010, planktonic algae Alexandrium minutum, cause of the PSP (Paralytic Shellfish Poisoning) syndrome, has been proliferating in early summer in the bay of Daoulas, within the roadstead of Brest. During this internship, a model has been designed in order to derive these blooms from physical parameters (temperature, irradiance, nutrient supply, dilution rate …). In the model, A.minutum competes with 50 other plankton species with randomly attributed optimal temperature and nutrient uptake abilities. It turns out to reproduce well the bloom of 2012, with a correct date of maximum concentration and a relevant order of magnitude. It reproduces the order of magnitude of 2013 concentrations, but the bloom then is too spread in time around the maximum....
Tipo: Text Palavras-chave: Alexandrium minutum; Phytoplancton; Efflorescence (bloom); Nutriments; Lumière; Température; Dilution; Absorption (uptake); Quota cellulaire; Croissance; Compétition; Modèle; Rade de Brest.
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00209/32004/30442.pdf
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Cultures et élevages de masse dans le contexte d'une écloserie-nurserie de mollusques bivalves : les productions phytoplanctoniques et le grossissement des post-larves ArchiMer
Le Borgne, Y.; Marin, J.; Vergonzanne, G..
The hatchery-nursery from the Société Atlantique de Mariculture settled in Barfleur studied within the ECOTRON program set up by C.N.E.X.O. the characteristics of mass cultures for monospecific phytoplancton and of the rearing of oyster spat (Ostrea edulis. Crassostrea giqas) and clam spat (Venerupis semi­decussata) . The maintenance features of the cultures in order to obtain cell densities around 1 million cell/ml. (or 50 g. of dry weight/m3) in containers up to 5000 liters have been established for the main species used in aquaculture (Isochrysis qalbana. Monochrysis lutheri, Tetraselmis suecica. Skeletonema costatum. Phaeodactylum tricornutum. Cyclotella nana, Chaetoceros calcitrans). The spat growth in nursery without providing any cultured food...
Tipo: Text Palavras-chave: Écloserie; Nurserie; Phytoplancton; Bivalves; Naissain; Hatchery; Nursery; Phytoplancton; Bivalves; Spat.
Ano: 1979 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00305/41658/40867.pdf
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Etat de la situation sanitaire des zones de production conchylicole dans les Pertuis Charentais. Volet 2 : Phytoplancton ArchiMer
Ryckaert, Mireille; Margat, Sylvie; Derrien, Annick; Schmitt, Anne; Thomas, Gerard.
Après un rappel de la réglementation concernant la qualité sanitaire des coquillages d’élevage, ainsi qu’une présentation du (REPHY*), un bilan sur les risques sanitaires liés au phytoplancton toxique est réalisé en 2008. Trois familles de toxines sont passées en revue, ainsi que les espèces phytoplanctoniques potentiellement émettrices de ces toxines. Il s’agit des toxines diarrhéiques (DSP) associées aux dinoflagellés du genre Dinophysis, paralysantes (PSP) émises par le dinoflagellé Alexandrium et amnésiantes (ASP) sécrétées par des diatomées du genre Pseudo-nitzschia. Le bilan fait la synthèse des données issues du REPHY depuis 1984 avec une analyse plus précise de 1998 à 2008. La hiérarchisation des risques montre une prépondérance des évènements liés...
Tipo: Text Palavras-chave: Zones conchylicoles; Pertuis Charentais; Phytoplancton; Phycotoxine.
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00123/23419/21246.pdf
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Observations préliminaires recueillies dans l'exécution des programmes entrepris par la station biologique de Roscoff ArchiMer
Bergerard, S..
We have tried to expose here the first observations on the basis of , previous knowledge and studies in progress when the wreck arrived, in particulary of benthic Populations Dynamics by the workers of the Biological Station. These results, still very fragmentary, allow never the less to definite the programs required for the second phase, essentially on the populations of fine deposits of the Morlaix and Lannion bays.
Tipo: Text Palavras-chave: Pollution; Hydrocarbures; Amoco Cadiz; Sédiments; Phytoplancton; Macrobenthos; Meiobenthos; Microbenthos; Baie de Morlaix; Baie de Lannion; Pollution; Hydrocarbons; Amoco Cadiz; Sediments; Phytoplancton; Macrobenthos; Meiobenthos; Microbenthos; Morlaix Bay; Lannion Bay.
Ano: 1978 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00306/41725/40936.pdf
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Surveillance hydrologique et phytoplanctonique du site AREVA NC (La Hague) Année 2006 ArchiMer
Lampert, Luis.
The hydrological (temperature, salinity, nitrate, nitrite, ammonium, phosphate and dissolved oxygen) and phytoplanktonic (biomass and cell abundances) results obtained on the points of Jobourg and Barneville during the nine 2006 cruises, do not enable the characterisation of an influence of non-active waste from the AREVA NC plant of La Hague on the environment.
Tipo: Text Palavras-chave: AREVA; COGEMA; Manche/Cotentin; Nutriments; Hydrologie; Phytoplancton.
Ano: 2007 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/rapport-3835.pdf
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Le maximum saisonnier de Dynophysis cf acuminata à Antifer (Normandie, France) ArchiMer
Lassus, Patrick; Maggi, Pierre; Proniewski, F.; Truquet, Philippe; Bardouil, Michele.
Since 1987 Antifer oil tanker terminal (Normandy, France) was weIl known, as a preferential area for summer highest blooms of Dinophysis cf acuminata, a toxic dinoflagellate. Three oceanographic cruises were made in August 1989, before, in the course of and after the seasonal max. of this species. Results obtained from these cruises (hydrological parameters and phytoplankton) as weIl as from a daily survey at a reference station in Antifer harbour, corrobora te the prevailing role of coastal up flowing of Seine estuarine waters, pushed to the coast by a dominant S - SW wind, on intensity and duration of Dinophysis bloom. Such observations are in agreement with those of Summer 1987 at reference station.
Tipo: Text Palavras-chave: Antifer; Dinophysis; Hydrologie; Phytoplancton; Antifer; Dinophysis; Hydrology; Phytoplankton.
Ano: 1990 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00138/24946/23039.pdf
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Etude pluridisciplinaire en écologie lagunaire (étang de Thau, France) : stratégie d'échantillonnage et organisation spatiale du phytoplancton ArchiMer
Jarry, Vincent.
Une étude pluridisciplinaire sur l'écologie l'étang de Thau a permis de récolter une quantité importante d'information, à quatre périodes différentes de l'année (1986-1987), sur un réseau de 63 stations réparties selon un maillage carré de 1 km. Fort de cette information multivariée nous proposons une méthodologie pour sélectionner un sous-ensemble de station (20) permettant de reproduire la répartition spatiale d'une dizaine de variables environnementales. Après cette première réflexion sur la stratégie d'échantillonnage, nous abordons en deux étapes l'étude du phytoplancton de l'étang de Thau. En premier lieu, en comparant la répartition spatiale de pigments chlorophylliens (chlorophylle a, chlorophylle b et chlorophylle c) avec celle des communautés...
Tipo: Text Palavras-chave: Phytoplancton; Pigments chlorophylliens; Structure des communautés; Répartition spatiale; Écologie lagunaire; Modélisation écologique; Stratégie d'échantillonnage; Analyses multivariées.
Ano: 1990 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00055/16579/14081.pdf
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Qualité du Milieu Marin Littoral - Bulletin de la surveillance - Edition 2009 - Départements : Charente- Maritime & Vendée (Sud) ArchiMer
Ifremer.
Le Laboratoire Environnement Ressources des Pertuis Charentais opère, sur le littoral des départements de Charente-Maritime et de Vendée (partie sud), les réseaux de surveillance nationaux1 de l'Ifremer dont une description succincte est présentée ci-dessous. Les résultats figurant dans ce bulletin sont obtenus à partir de données validées extraites de la base Ifremer Quadrige (base des données de la surveillance de l'environnement marin littoral), données recueillies jusqu’en 2008, REMI Réseau de contrôle microbiologique : REPHY Réseau de surveillance du phytoplancton et des phycotoxines, ROCCH Réseau d’observation de la contamination chimique, REMORA Réseau mollusques des ressources aquacoles, REMOULA Réseau régional de suivi de la croissance des moules
Tipo: Text Palavras-chave: Surveillance pollution; Milieu marin; Réseau observation; Zone littorale; Phytoplancton; Metal lourd; Toxicité; Escherichia coli; Alexandrium; Dinophysis; Charente Maritime; Vendée Sud.
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00041/15213/12540.pdf
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Campagne de surveillance DCE 2015 en Méditerranée française. Districts « RHONE ET COTIERS MEDITERRANEENS » ET « CORSE » ArchiMer
Witkowski, Fanny; Andral, Bruno; Derolez, Valerie; Tomasino, Corinne.
Sur la façade méditerranéenne, l'Ifremer a assuré en 2015 une partie logistique de la quatrième campagne du contrôle de surveillance DCE et la coordination de la caractérisation de plusieurs éléments de qualité. Les résultats de la quatrième campagne de contrôles de surveillance DCE permettent de caractériser la qualité de 45 masses d’eau littorales suivies en 2015. Dans le district « Rhône et côtiers méditerranéens » (volet 1), 3 des 18 masses d’eau côtières (MEC) sont déclassées pour la chimie au regard des résultats acquis dans la matière vivante, tandis que l'ensemble des MEC suivies pour le phytoplancton affichent un bon état. Dans les masses d’eau de transition (MET), la chimie matière vivante déclasse 7 MET, le suivi dans l'eau (échantillonneurs...
Tipo: Text Palavras-chave: Surveillance; Phytoplancton; Macrophytes; Substances prioritaires; Bioaccumulation; État biologique; État chimique; Eaux côtières; Eaux de transition.
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00394/50583/51272.pdf
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Réseau Hydrologique Littoral Normand (RHLN) - Suivi 2009 ArchiMer
Nedelec, Florence; Lejolivet, Aurore; Riou, Philippe.
Le Réseau Hydrologique Littoral Normand (RHLN) pérenne a été approuvé en 2007 par ses partenaires, avec le triple objectif (1) de maintenir le suivi de la qualité des masses d’eau et évaluer leur niveau d’eutrophisation en réponse aux réglementations (Directive Nitrate, OSPAR, DCE), (2) de poursuivre la réflexion sur la définition des indicateurs DCE, puis (3) de développer les connaissances et de fournir des données à la modélisation. Ce rapport réalise la synthèse des résultats obtenus en 2009, deuxième année de la mise en oeuvre du RHLN pérenne. L’analyse des cycles hydrologiques observés au sein des différentes masses d’eau normandes en 2009 a permis de mettre en évidence le caractère plus « sec » du point de vue météorologique par rapport à l’année...
Tipo: Text Palavras-chave: Ecosystème côtier; Hydrologie; Normandie; Baie de Seine; Eutrophisation; DCE; Phytoplancton; Réseau hydrologique; RHLN..
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00051/16178/13663.pdf
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Directive Cadre sur l'Eau. Mise en place du contrôle de surveillance dans les masses d'eau côtières du bassin Loire-Bretagne. Bilan des actions réalisées en 2007 ArchiMer
Oger-jeanneret, Helene.
Le réseau de contrôle de surveillance (RCS) de la DCE a démarré en 2007 sur le littoral Loire Bretagne (du Mont Saint-Michel à La Rochelle). Il a été développé en partenariat entre l' lfremer et l'Agence de l'Eau Loire-Bretagne. Ce rapport fait le bilan des lieux de surveillance retenus et des paramètres analysés en 2007. Les résultats de la surveillance feront l'objet d'un rapport ultérieur
Tipo: Text Palavras-chave: DCE; AELB; Ifremer; Contrôle de surveillance; Hydrologie; Phytoplancton; Macroalgues; Invertébrés benthiques.
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00422/53392/54255.pdf
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Qualité du Milieu Marin Littoral - Bulletin de la surveillance - Edition 2010 - Départements : Charente- Maritime & Vendée (Sud) ArchiMer
Ifremer.
Le Laboratoire Environnement Ressources des Pertuis Charentais opère, sur le littoral des départements de Charente-Maritime et de Vendée (partie sud), les réseaux de surveillance nationaux de l'Ifremer dont une description succincte est présentée ci-dessous, ainsi que des réseaux régionaux. Les résultats figurant dans ce bulletin sont obtenus à partir de données validées extraites de la base Ifremer Quadrige (base des données de la surveillance de l'environnement marin littoral), données recueillies jusqu’en 2009 : REMI Réseau de contrôle microbiologique, REPHY Réseau de surveillance du phytoplancton et des phycotoxines, ROCCH Réseau d’observation de la contamination chimique, REMORA Réseau mollusques des ressources aquacoles, REMOULA Réseau régional de...
Tipo: Text Palavras-chave: Surveillance pollution; Milieu marin; Réseau observation; Zone littorale; Phytoplancton; Metal lourd; Toxicité; Escherichia coli; Alexandrium; Dinophysis; Charente Maritime; Vendée Sud.
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00041/15216/12541.pdf
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Rapport d'activités 2019 du Laboratoire Environnement Ressources du Morbihan Pays de Loire ArchiMer
Cochennec-laureau, Nathalie; Bizzozero, Lucie; Bonneau, Francoise; Bouget, Jean-francois; Bouvier, Calypso; Collin, Karine; Fortune, Mireille; Gabellec, Raoul; Le Merrer, Yoann; Manach, Soazig; Pierre-duplessix, Olivier; Retho, Michael; Roux, Pauline; Schapira, Mathilde; Schmitt, Anne; Souchu, Philippe; Stanisiere, Jean-yves; Villedieu, Anouk.
Activités d’observation, de surveillance de la qualité des eaux littorales du Morbihan, Pays de la Loire et Nord Vendée et résultats des projets de recherche 2019
Tipo: Text Palavras-chave: Réseaux de surveillance et d’observation; Qualité des écosystèmes marins littoraux du Morbihan; Pays de la Loire; Microbiologie; Phytoplancton; Eutrophisation; Ressources exploitées; Huîtres; Moules.
Ano: 2020 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00630/74217/73849.pdf
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Fascicule technique pour la mise en oeuvre des suivis "Paramètres Physico-Chimiques & Phytoplancton" des réseaux de contrôle de surveillance DCE dans l’océan Indien ArchiMer
GTs DCE La Réunion et Mayotte "Physico-Chimie et Phytoplancton".
Les travaux relatifs à la mise en œuvre de la DCE à La Réunion ont démarré au début des années 2000, avec la mise en place de 4 groupes de travail DCE experts dont les travaux ont été synthétisés au travers de 4 fascicules techniques définissant les conditions de mise en œuvre des différents suivis du réseau de contrôle de surveillance (RCS) DCE en milieu marin à la Réunion. Une première version du fascicule "Physico-chimie & phytoplancton", a été produite en 2012 et validée au niveau national par les référents DCE (Coordination "phytoplancton", Coordination "hydrologie", Coordination nationale DCE milieu Marin, responsable projet Quadrige). Le Parc Naturel Marin de Mayotte (PNMM) est chargé de la mise en œuvre de la DCE sur ce territoire depuis 2013,...
Tipo: Text Palavras-chave: DCE; La Réunion; Mayotte; Contrôle de surveillance; Hydrologie; Paramètres physico-chimiques; Phytoplancton.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00168/27915/63603.pdf
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Résultats de la mise en oeuvre des réseaux REPHY et SRN – Zones côtières de la Manche orientale et de la baie sud de la Mer du Nord – Bilan de l’année 2016. ArchiMer
Lefebvre, Alain; Ambiaud, Antonin.
The coastal zone of the Nord – Pas de Calais / Picardie showed dysfonctioning patterns of the ecosystem considered to be link to human activities along shores. These results in regular massive development of species, such as the phytoplanktonic seaweed, Phaeocystis sp. which life cycle was partly linked to nutrients availability and consequently to anthropogenic inputs. As part of the evaluation of the influence of continental inputs on the marine environment (nitrates, phosphates,…) and on potential eutrophication processes, of the estimation of the efficiency of the sewage treatments plants in the possible elimination of dumpings and in order to establish a long-term survey to follow up the change in coastal waters quality, the regional nutrients...
Tipo: Text Palavras-chave: Manche Orientale; Baie sud de la Mer du Nord; Hydrologie; Phytoplancton; Phaeocystis globosa; Eastern English Channel – southern bight of the North Sea; Hydrology; Phytoplankton; Phaeocystis globosa.
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00396/50746/51459.pdf
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